[1] 水面下（海面下）に隠れていて見えな岩や珊瑚礁（さんごしょう）。

例）
・船が暗礁に乗り上げる

[2] 急に遭遇した困難。

例）
・暗礁に乗り上げる
（＝思わぬ障害にぶつかり、物事がうまく進行しなくなる）
・捜査が暗礁に乗り上げる